More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1204 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  100 
 
 
363 aa  743    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  79.38 
 
 
357 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  70.82 
 
 
357 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  61.47 
 
 
353 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  60.4 
 
 
352 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  60.62 
 
 
353 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  55.56 
 
 
351 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  54.13 
 
 
351 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  54.99 
 
 
351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  54.99 
 
 
351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  55.03 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  54.86 
 
 
351 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  50.86 
 
 
362 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  52.42 
 
 
351 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  48.6 
 
 
363 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  39.56 
 
 
365 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  40.13 
 
 
317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  38.22 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  40.33 
 
 
239 aa  169  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.2 
 
 
299 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
263 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 
286 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 
283 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
305 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  28.57 
 
 
305 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4441  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  27.27 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  29.15 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0872  hypothetical protein  28.85 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  34.42 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.57 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  26.92 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4431  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.184386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4369  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  32.28 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4009  type 11 methyltransferase  27.2 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2359  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.54 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 
199 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  26.5 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.76 
 
 
221 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 
275 aa  63.9  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3698  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.12 
 
 
205 aa  62.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.83 
 
 
215 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2783  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
190 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  40.71 
 
 
200 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
298 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  40.71 
 
 
200 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_41  SAM dependent methyltransferase, UbiE family  25.95 
 
 
202 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000057615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.55 
 
 
245 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  32.22 
 
 
233 aa  59.7  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
270 aa  60.1  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.88 
 
 
247 aa  59.7  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
206 aa  59.7  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.11 
 
 
213 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.92 
 
 
220 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  31.75 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
228 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1055  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13866  hypothetical protein  27.65 
 
 
191 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_4846  predicted protein  27.56 
 
 
218 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291862  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  23.48 
 
 
296 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 
275 aa  57.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.4 
 
 
282 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  32.54 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
295 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
252 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  23.75 
 
 
287 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2172  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.78 
 
 
266 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
267 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  37.84 
 
 
202 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
227 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1384  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.43 
 
 
247 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44871  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
231 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
217 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  29.8 
 
 
201 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
278 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
271 aa  56.2  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0069  demethylmenaquinone methyltransferase  35.64 
 
 
258 aa  56.2  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.91 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.91 
 
 
258 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  29.91 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  29.91 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.91 
 
 
258 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
243 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.19 
 
 
234 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
204 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
251 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
309 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1347  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.24 
 
 
260 aa  55.5  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.86 
 
 
207 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.66 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>