41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0996 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  318  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  80.14 
 
 
170 aa  215  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  73.04 
 
 
151 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  40.43 
 
 
151 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  40.43 
 
 
151 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  38.41 
 
 
155 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  36.62 
 
 
152 aa  97.8  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  42.14 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  40.27 
 
 
165 aa  94  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  40.15 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  41.76 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  38.33 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1541  hypothetical protein  35.81 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  38.75 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  31.88 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  33.64 
 
 
138 aa  61.2  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  31.4 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  26.87 
 
 
175 aa  57.8  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  32.26 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  30.95 
 
 
188 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  37.8 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  30.67 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  33.8 
 
 
188 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  30.2 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  29.79 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  28.76 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  30.82 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  31.01 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  35.16 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1995  hypothetical protein  31.97 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  32.94 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1128  hypothetical protein  30.59 
 
 
300 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.163819  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  28.47 
 
 
163 aa  44.7  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  29.85 
 
 
163 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  37.5 
 
 
186 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  29.5 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2922  hypothetical protein  39.06 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.389384 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1591  hypothetical protein  27.06 
 
 
146 aa  42  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  32.8 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>