More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4566 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3842  GTP cyclohydrolase I  94.52 
 
 		 219 aa  410  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  92.69 
 
 		 219 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  91.04 
 
 		 214 aa  384  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0383  GTP cyclohydrolase I  90.95 
 
 		 216 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0244609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0397  GTP cyclohydrolase I  90.95 
 
 		 216 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000172091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0372  GTP cyclohydrolase I  90.95 
 
 		 216 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0371  GTP cyclohydrolase I  90.95 
 
 		 216 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4254  GTP cyclohydrolase I  90.48 
 
 		 216 aa  377  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  90.48 
 
 		 214 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  87.74 
 
 		 216 aa  370  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  87.74 
 
 		 216 aa  370  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  87.74 
 
 		 216 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  89.05 
 
 		 216 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0322  GTP cyclohydrolase I  89.05 
 
 		 216 aa  368  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  86.79 
 
 		 217 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  80 
 
 		 217 aa  352  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  80.95 
 
 		 230 aa  352  2.9999999999999997e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  80 
 
 		 217 aa  351  5e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  69.95 
 
 		 222 aa  324  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  69.67 
 
 		 227 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  71.9 
 
 		 220 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  71.9 
 
 		 220 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  71.9 
 
 		 220 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  72.38 
 
 		 221 aa  303  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  70.28 
 
 		 222 aa  301  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  71.7 
 
 		 222 aa  298  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  70.75 
 
 		 222 aa  295  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  70.75 
 
 		 222 aa  295  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  70.75 
 
 		 222 aa  295  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  70.75 
 
 		 222 aa  295  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  70.75 
 
 		 222 aa  295  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  70.75 
 
 		 222 aa  295  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  70.75 
 
 		 222 aa  295  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  70.75 
 
 		 222 aa  295  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  70.75 
 
 		 222 aa  295  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1933  GTP cyclohydrolase I  78.3 
 
 		 217 aa  295  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  70.28 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  70.28 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  70.28 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  70.28 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  70.28 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2306  GTP cyclohydrolase I  72.17 
 
 		 222 aa  281  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  62.09 
 
 		 218 aa  281  5.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  60.62 
 
 		 227 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1941  GTP cyclohydrolase I  69.81 
 
 		 220 aa  278  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0853389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1670  GTP cyclohydrolase I  70.48 
 
 		 220 aa  277  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0394  GTP cyclohydrolase I  66.2 
 
 		 220 aa  275  3e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.457978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  53.03 
 
 		 214 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  53.57 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  50.75 
 
 		 239 aa  207  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  52.04 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  49.75 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  48.98 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  48.97 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  43.86 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  41.24 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  47.25 
 
 		 198 aa  146  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  44.69 
 
 		 200 aa  146  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  42.77 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  44.94 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  45 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  41.67 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  43.01 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  45.11 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  43.33 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  43.41 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  42.08 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  41.34 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3643  GTP cyclohydrolase I  43.03 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0117786  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  43.58 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  44.2 
 
 		 187 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  43.58 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  43.58 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  41.88 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  43.58 
 
 		 202 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  41.99 
 
 		 188 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  42.78 
 
 		 185 aa  138  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  43.65 
 
 		 186 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  42.54 
 
 		 202 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  41.99 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  41.26 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  41.53 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  41.26 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  41.21 
 
 		 188 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  42.31 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  42.08 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  37.99 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  40.98 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3354  GTP cyclohydrolase  39.89 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  38.55 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  42.08 
 
 		 188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  37.08 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  40.59 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  40.98 
 
 		 213 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  36.5 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  40.34 
 
 		 205 aa  134  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  43.02 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>