More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1505 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  96.38 
 
 		 222 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  96.38 
 
 		 222 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  96.38 
 
 		 222 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  96.38 
 
 		 222 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  96.38 
 
 		 222 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  95.05 
 
 		 222 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  89.64 
 
 		 221 aa  387  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  89.19 
 
 		 220 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  89.19 
 
 		 220 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  89.19 
 
 		 220 aa  388  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  89.5 
 
 		 222 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2306  GTP cyclohydrolase I  89.95 
 
 		 222 aa  363  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1670  GTP cyclohydrolase I  88.29 
 
 		 220 aa  362  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1941  GTP cyclohydrolase I  87.84 
 
 		 220 aa  359  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0853389  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  71.23 
 
 		 217 aa  322  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0394  GTP cyclohydrolase I  75.69 
 
 		 220 aa  322  2e-87  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.457978  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  71.23 
 
 		 217 aa  322  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  70.32 
 
 		 230 aa  315  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  69.34 
 
 		 222 aa  305  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3842  GTP cyclohydrolase I  70.75 
 
 		 219 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0397  GTP cyclohydrolase I  69.48 
 
 		 216 aa  297  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000172091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0383  GTP cyclohydrolase I  69.48 
 
 		 216 aa  297  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0244609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0372  GTP cyclohydrolase I  69.48 
 
 		 216 aa  297  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0371  GTP cyclohydrolase I  69.48 
 
 		 216 aa  297  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  69.81 
 
 		 219 aa  296  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  70.75 
 
 		 219 aa  296  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  67.44 
 
 		 227 aa  296  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  69.01 
 
 		 214 aa  295  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  69.95 
 
 		 214 aa  294  9e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4254  GTP cyclohydrolase I  69.77 
 
 		 216 aa  293  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  69.01 
 
 		 216 aa  291  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  69.01 
 
 		 216 aa  291  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  68.66 
 
 		 216 aa  290  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  69.01 
 
 		 216 aa  289  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0322  GTP cyclohydrolase I  68.66 
 
 		 216 aa  289  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  69.12 
 
 		 217 aa  287  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  63.26 
 
 		 218 aa  284  8e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 227 aa  284  9e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1933  GTP cyclohydrolase I  71.23 
 
 		 217 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  53.81 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  52.88 
 
 		 241 aa  217  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  55.39 
 
 		 229 aa  218  8.999999999999998e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  54.04 
 
 		 239 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  51.26 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  49.25 
 
 		 223 aa  197  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  44.19 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  43.46 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  43.41 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  46.15 
 
 		 187 aa  142  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  41.09 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  42.27 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  43.1 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  43.18 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  39.34 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  39.34 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  41.33 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  42.77 
 
 		 185 aa  138  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  43.78 
 
 		 226 aa  137  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  41.15 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  43.18 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  43.2 
 
 		 185 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  53.6 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  41.99 
 
 		 188 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  37.8 
 
 		 212 aa  134  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  41.57 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  40.8 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  44.05 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  41.71 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1665  GTP cyclohydrolase  40.24 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.109192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  40.7 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  37.37 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  44.24 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  37.37 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  49.6 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  44.24 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  42.37 
 
 		 194 aa  131  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  44.19 
 
 		 202 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  38.66 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  40.54 
 
 		 186 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  39.33 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  40.57 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  42.51 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  42.44 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  43.35 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  42.44 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  43.02 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  43.6 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  41.01 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  42.35 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  43.02 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>