More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3602 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  99.54 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4254  GTP cyclohydrolase I  96.76 
 
 		 216 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0372  GTP cyclohydrolase I  95.37 
 
 		 216 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0397  GTP cyclohydrolase I  95.37 
 
 		 216 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000172091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0383  GTP cyclohydrolase I  95.37 
 
 		 216 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0244609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0371  GTP cyclohydrolase I  95.37 
 
 		 216 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  95.79 
 
 		 214 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  91.2 
 
 		 216 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  89.35 
 
 		 217 aa  387  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0322  GTP cyclohydrolase I  89.35 
 
 		 216 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  87.74 
 
 		 219 aa  370  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3842  GTP cyclohydrolase I  87.74 
 
 		 219 aa  370  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  86.45 
 
 		 214 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  85.78 
 
 		 219 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  78.77 
 
 		 230 aa  354  6.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  77.83 
 
 		 217 aa  353  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  77.83 
 
 		 217 aa  351  5.9999999999999994e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  69.05 
 
 		 222 aa  316  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  72.99 
 
 		 221 aa  308  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  69.19 
 
 		 227 aa  308  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  70.14 
 
 		 220 aa  297  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  70.14 
 
 		 220 aa  297  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  70.14 
 
 		 220 aa  297  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  70.42 
 
 		 222 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  69.52 
 
 		 222 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  69.01 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  69.01 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  69.01 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  69.01 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  69.01 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  69.01 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  69.01 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  69.01 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  69.01 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1933  GTP cyclohydrolase I  76.89 
 
 		 217 aa  288  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  68.54 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  68.54 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  68.54 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  68.54 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  68.54 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  61.61 
 
 		 227 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  60.95 
 
 		 218 aa  278  5e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2306  GTP cyclohydrolase I  71.43 
 
 		 222 aa  276  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1670  GTP cyclohydrolase I  70.62 
 
 		 220 aa  275  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1941  GTP cyclohydrolase I  70.95 
 
 		 220 aa  275  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0853389  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0394  GTP cyclohydrolase I  64.62 
 
 		 220 aa  265  4e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.457978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  52.28 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  52.76 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  53.57 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  51.28 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  47.74 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  46.97 
 
 		 223 aa  184  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  47.74 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  42.44 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  46.11 
 
 		 187 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  41.95 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  43.39 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  43.33 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  39.06 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  43.5 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  43.58 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  38.3 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  43.72 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  41.15 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  41.67 
 
 		 185 aa  138  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  40.58 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  36.36 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  40.58 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  42.41 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  36.46 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  44.02 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  42.31 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  40.66 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  42.86 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  37.77 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  41.99 
 
 		 188 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  41.27 
 
 		 202 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  42.86 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  40.66 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  42.86 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  42.39 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  41.34 
 
 		 193 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  40 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3643  GTP cyclohydrolase I  41.46 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0117786  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  37.82 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  38.97 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  38.29 
 
 		 189 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  36.36 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  40.5 
 
 		 200 aa  134  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  41.53 
 
 		 190 aa  134  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  42.22 
 
 		 223 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  39.01 
 
 		 211 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  40.11 
 
 		 247 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  41.76 
 
 		 199 aa  134  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  42.16 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>