More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2270 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 223 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  78.24 
 
 		 225 aa  363  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  75.81 
 
 		 223 aa  358  5e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  63.85 
 
 		 229 aa  298  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  63.33 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  61.79 
 
 		 214 aa  290  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  59.62 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  59.72 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  51.26 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  53.72 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  50.75 
 
 		 217 aa  202  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  47.57 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  49.75 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  47.37 
 
 		 222 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  47.37 
 
 		 222 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  47.37 
 
 		 222 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  47.37 
 
 		 222 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  47.37 
 
 		 222 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  49.25 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  49.25 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  49.25 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  49.25 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  49.25 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  49.25 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  49.25 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  49.25 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  49.25 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  48.24 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  47.55 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  47.55 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  47.55 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  47.85 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  45.93 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  51.32 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4254  GTP cyclohydrolase I  48.72 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  47.57 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0372  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0383  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0244609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0371  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0397  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000172091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3842  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  47.74 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  47.74 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  47.74 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0322  GTP cyclohydrolase I  50.81 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  48.39 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0394  GTP cyclohydrolase I  46.77 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.457978  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  48.65 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1670  GTP cyclohydrolase I  45.93 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2306  GTP cyclohydrolase I  45.71 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1941  GTP cyclohydrolase I  45.93 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0853389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1933  GTP cyclohydrolase I  52.87 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  48.63 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  44.62 
 
 		 189 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  44.09 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  44.09 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  43.41 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  45.6 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  44.89 
 
 		 185 aa  151  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  43.59 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  43.92 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  43.41 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  43.5 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  41.97 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  41.58 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  44.57 
 
 		 190 aa  148  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  41.88 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  45.51 
 
 		 185 aa  147  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  42.78 
 
 		 187 aa  147  9e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  40.87 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  41.15 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  43.72 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  40.88 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1665  GTP cyclohydrolase  40.59 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.109192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  42.77 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  39.59 
 
 		 200 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  41.71 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  39.88 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  41.84 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  45.2 
 
 		 189 aa  146  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  40.76 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  45.41 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  39.88 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  41.53 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  44.26 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  41.75 
 
 		 226 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  41.84 
 
 		 239 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  41.84 
 
 		 239 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  43.78 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  39.66 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  42.62 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  45.25 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  43.5 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>