43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4464 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  95.93 
 
 
978 bp  1100    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  99.07 
 
 
978 bp  1437    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  90.35 
 
 
978 bp  807    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4464    100 
 
 
753 bp  1493    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  90.74 
 
 
978 bp  823    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  86.57 
 
 
978 bp  505  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  86.21 
 
 
978 bp  490  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  85.48 
 
 
978 bp  458  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4372    93.39 
 
 
808 bp  375  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0356    96.34 
 
 
357 bp  278  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  85.8 
 
 
972 bp  135  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  84.66 
 
 
597 bp  119  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  84.96 
 
 
978 bp  89.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1553    85.71 
 
 
968 bp  83.8  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  81.62 
 
 
978 bp  81.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  81.58 
 
 
978 bp  79.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  78.42 
 
 
978 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  84.16 
 
 
951 bp  73.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  81.82 
 
 
978 bp  71.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  78.06 
 
 
978 bp  67.9  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1377    82.86 
 
 
1010 bp  65.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  81.6 
 
 
561 bp  65.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  83.17 
 
 
978 bp  65.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  78.73 
 
 
978 bp  65.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  83.7 
 
 
978 bp  63.9  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  88.89 
 
 
972 bp  60  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  79.03 
 
 
981 bp  60  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  78.44 
 
 
978 bp  60  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  81.9 
 
 
624 bp  58  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  81.9 
 
 
981 bp  58  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  83.15 
 
 
978 bp  58  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  79.72 
 
 
981 bp  54  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3403    83.13 
 
 
980 bp  54  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  79.35 
 
 
978 bp  54  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  82.02 
 
 
960 bp  50.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  82.02 
 
 
978 bp  50.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  81.19 
 
 
978 bp  50.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  81.19 
 
 
978 bp  50.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  100 
 
 
1038 bp  48.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  81 
 
 
981 bp  48.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    85.71 
 
 
902 bp  48.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    85.71 
 
 
1107 bp  48.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  78.95 
 
 
978 bp  48.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>