47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1192 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1192  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  52.32 
 
 		 255 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  53.54 
 
 		 262 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  47.76 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  51.77 
 
 		 262 aa  238  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  47.35 
 
 		 254 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  47.83 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  51.34 
 
 		 263 aa  238  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  47.43 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  47.83 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  47.43 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  47.47 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  45.28 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0283  YcgL  45.74 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  47.86 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  44.88 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0599  hypothetical protein  45.97 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  44.88 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  44.49 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  47.18 
 
 		 263 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  46.69 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  46.69 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  44.09 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  47.43 
 
 		 260 aa  229  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  48.18 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  43.87 
 
 		 270 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0339  hypothetical protein  40.93 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  44.8 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  48.26 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0124  hypothetical protein  43.87 
 
 		 259 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.045429  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  42.97 
 
 		 273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  43.65 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  38.13 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  39.45 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  42.23 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  35.02 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0487  Nucleotidyltransferase, predicted  27.6 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1947  nucleotidyltransferase-like  24.29 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.685938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  27.04 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  30.77 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2851  Nucleotidyltransferase, predicted  22.54 
 
 		 358 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  31.46 
 
 		 356 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  27.5 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  28.36 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  32.32 
 
 		 364 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4228  hypothetical protein  27.54 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  24.79 
 
 		 258 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>