69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0549 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0549  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
96 aa  202  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  35.82 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.72 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.59 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12762  hypothetical protein  28.74 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.21885 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.74 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0846  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.59 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3607  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.84 
 
 
103 aa  48.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
99 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  31.34 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  31.34 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  29.27 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  26.25 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3536  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
210 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  34.29 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  27.85 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.69 
 
 
100 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.58 
 
 
95 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.91 
 
 
99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.06 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  27.78 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07090  hypothetical protein  25.29 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.91 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.14 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.29 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.65 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.84 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.88 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  29.41 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.88 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  26.67 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.67 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
106 aa  40.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.65 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  20.88 
 
 
95 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>