232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2217 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2217  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  604  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0008  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0076  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0273  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0328  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.67866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0642  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1136  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1348  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.554323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1452  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.618875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1751  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2041  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00623438  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2110  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2211  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2309  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2321  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0179767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2384  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2568  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.467785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2653  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2658  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1281  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.942736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1557  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2174  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 
523 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0716  Integrase catalytic region  26.27 
 
 
524 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.323373  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  28.12 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0026  integrase catalytic subunit  25 
 
 
512 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1296  integrase catalytic subunit  25 
 
 
512 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2216  integrase catalytic subunit  25 
 
 
512 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
449 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
449 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  28.73 
 
 
412 aa  75.9  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  27.17 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1530  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 
523 aa  72.4  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2334  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 
523 aa  72.4  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  30.53 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  30.53 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  30.53 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  30.53 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  30.53 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  30.53 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  30.53 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  30.53 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  30.53 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  36.67 
 
 
507 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3900  integrase catalytic subunit  29.37 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6440  Integrase catalytic region  34.65 
 
 
508 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000175464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1192  Integrase catalytic region  34.65 
 
 
508 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3857  Integrase catalytic region  34.65 
 
 
508 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  28.68 
 
 
413 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  37.63 
 
 
610 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 
434 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 
434 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0836  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 
531 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.649092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1342  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 
531 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2443  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 
531 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45047  normal  0.859725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3086  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 
531 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  25.76 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1591  integrase catalytic region  27.7 
 
 
408 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1968  integrase catalytic region  27.7 
 
 
408 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4926  integrase catalytic region  27.7 
 
 
408 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409648  normal  0.357662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3160  integrase catalytic region  27.7 
 
 
408 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2854  integrase catalytic region  27.7 
 
 
408 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1024  integrase catalytic region  27.7 
 
 
408 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  28.48 
 
 
512 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  28.48 
 
 
512 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3040  Integrase catalytic region  33.91 
 
 
421 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000772165  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  31.68 
 
 
338 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  31.68 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>