More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0491 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  100 
 
 
340 aa  687    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  58.91 
 
 
330 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  43.81 
 
 
341 aa  251  9.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  43.94 
 
 
313 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  41.48 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.3 
 
 
317 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.94 
 
 
334 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  45.4 
 
 
313 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.41 
 
 
324 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  40.71 
 
 
307 aa  229  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.46 
 
 
315 aa  225  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.27 
 
 
315 aa  225  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  36.24 
 
 
386 aa  225  9e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  38.04 
 
 
314 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  44.65 
 
 
310 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  44.65 
 
 
310 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  44.07 
 
 
314 aa  222  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  40.43 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  39.53 
 
 
311 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  37.93 
 
 
381 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.62 
 
 
316 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  37.33 
 
 
376 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  37.95 
 
 
381 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  39.88 
 
 
313 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  40.77 
 
 
313 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  36.66 
 
 
370 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1060  chaperone protein DnaJ  37.53 
 
 
380 aa  216  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00149105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  39.7 
 
 
306 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  39.7 
 
 
306 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  39.7 
 
 
306 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  39.7 
 
 
306 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  39.7 
 
 
306 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  41.26 
 
 
314 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  35.56 
 
 
373 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  35.99 
 
 
384 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  41.57 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.37 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  38.27 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  41.25 
 
 
314 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  40.84 
 
 
315 aa  212  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  36.05 
 
 
382 aa  212  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  39.2 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  39.2 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  35.69 
 
 
388 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  35.81 
 
 
379 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  36.16 
 
 
372 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  39.2 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  39.2 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  39.2 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  39.2 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  35.81 
 
 
379 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  39.2 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  42.86 
 
 
318 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  35.81 
 
 
379 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.7 
 
 
330 aa  210  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  36.54 
 
 
374 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  38.61 
 
 
373 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.62 
 
 
323 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  37.57 
 
 
375 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.71 
 
 
324 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  40.87 
 
 
319 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  37.27 
 
 
369 aa  209  5e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 
361 aa  209  5e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.21 
 
 
325 aa  209  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0127  chaperone DnaJ  37.97 
 
 
378 aa  209  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  38.89 
 
 
306 aa  209  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  39.6 
 
 
320 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  37.4 
 
 
379 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
376 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  36.73 
 
 
369 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  37.4 
 
 
379 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  37.4 
 
 
379 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  37.4 
 
 
379 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
376 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
376 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
376 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
376 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
376 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  37.4 
 
 
379 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  37.12 
 
 
374 aa  206  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.58 
 
 
319 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  37.29 
 
 
376 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  37.29 
 
 
376 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  38.1 
 
 
327 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  36.44 
 
 
387 aa  206  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  36.71 
 
 
381 aa  206  6e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 
377 aa  206  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.07 
 
 
289 aa  205  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  37.02 
 
 
376 aa  205  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 
377 aa  205  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  37.53 
 
 
388 aa  205  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  36.39 
 
 
335 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.47 
 
 
318 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  35.58 
 
 
370 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  37.1 
 
 
386 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  36.46 
 
 
335 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  40.43 
 
 
313 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.03 
 
 
319 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  36.14 
 
 
356 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  35.73 
 
 
372 aa  203  4e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>