More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4722 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
223 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  67.26 
 
 
223 aa  325  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  60.55 
 
 
223 aa  284  7e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  44.09 
 
 
222 aa  195  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  42.6 
 
 
222 aa  191  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  42.6 
 
 
221 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  42.15 
 
 
221 aa  188  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  40.72 
 
 
217 aa  180  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.26 
 
 
225 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.36 
 
 
222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 
225 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  37.95 
 
 
221 aa  175  6e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  41.07 
 
 
221 aa  174  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0439  glutathione S-transferase-like  43.88 
 
 
230 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3133  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.56 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  42.67 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2343  Glutathione S-transferase domain  41.99 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  37.67 
 
 
225 aa  170  2e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  41.15 
 
 
241 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2663  Glutathione S-transferase domain  41.56 
 
 
230 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2386  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.56 
 
 
230 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.09 
 
 
252 aa  168  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0662  glutathione S-transferase-like protein  42.62 
 
 
230 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1808  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.67 
 
 
280 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0584047  normal  0.113332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0171  glutathione S-transferase-like  42.19 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.53 
 
 
226 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0044  Glutathione S-transferase domain  42.02 
 
 
230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.6 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0341  glutathione S-transferase  42.42 
 
 
230 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3681  Glutathione S-transferase domain protein  40.69 
 
 
230 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0164  glutathione S-transferase  40.95 
 
 
230 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0185  glutathione S-transferase-like  40.95 
 
 
230 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0214  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.29 
 
 
230 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.163491  normal  0.307378 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4320  Glutathione S-transferase domain  40.35 
 
 
230 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4583  Glutathione S-transferase domain protein  40.35 
 
 
230 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5423  Glutathione S-transferase domain protein  41.56 
 
 
230 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.06 
 
 
230 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0222  putative glutathione S-transferase family protein  40.51 
 
 
230 aa  154  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1338  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.1 
 
 
230 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3313  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.41 
 
 
229 aa  151  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03107  normal  0.604378 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1050  glutathione S-transferase  37.23 
 
 
230 aa  150  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.087398  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0982  glutathione S-transferase family protein  38.1 
 
 
230 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1044  glutathione S-transferase family protein  38.1 
 
 
230 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3599  glutathione S-transferase-like  41.3 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  28.44 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  33.14 
 
 
220 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  31.82 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  26.37 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.93 
 
 
202 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  23 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  29.38 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  30.41 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  27.89 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  29.27 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  30.65 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  32.02 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  30.93 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  30.65 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  29.8 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.4 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  26.4 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  30.86 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.4 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.84 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  30.49 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.4 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  26.4 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  30.21 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  30.21 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  30.21 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  30.21 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  30.21 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  25.84 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  30.21 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  30.21 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  32.72 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.84 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  29.38 
 
 
204 aa  62.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  26.14 
 
 
203 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  29.38 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  27 
 
 
204 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  28.21 
 
 
203 aa  62  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  30.86 
 
 
203 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 
206 aa  62  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  25.73 
 
 
227 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.8 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  29.33 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4617  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.13 
 
 
194 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.236523  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2483  glutathione S-transferase-like protein  23.04 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.478501  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.28 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  29.14 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  27.14 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  29.59 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  26.21 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  30.43 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.23 
 
 
261 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>