46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4407 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4407  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  397  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386078  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  52.2 
 
 		 212 aa  198  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0428  twin-arginine translocation pathway signal  48.5 
 
 		 207 aa  176  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  48.66 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  53.05 
 
 		 211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  40.23 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  44.52 
 
 		 241 aa  106  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  41.57 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  35.12 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  35.12 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  37.02 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  40.24 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  38.83 
 
 		 226 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  42.66 
 
 		 245 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  41.96 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0554  hypothetical protein  42 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  39.86 
 
 		 251 aa  95.9  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  37.78 
 
 		 237 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  39.46 
 
 		 242 aa  92.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  38.1 
 
 		 235 aa  92  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  32.11 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  37.5 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  31.46 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  37.67 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  35.12 
 
 		 212 aa  87.8  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  38.36 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  34.8 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  34.87 
 
 		 248 aa  86.7  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1799  hypothetical protein  36.05 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  34.09 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  38.35 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  38.1 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  36.55 
 
 		 174 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2211  hypothetical protein  38.1 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  35.86 
 
 		 237 aa  85.1  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  38.19 
 
 		 241 aa  85.1  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  40.65 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  40.65 
 
 		 414 aa  82.4  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  38.19 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  35.86 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0865  hypothetical protein  35.29 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175184  normal  0.0645858 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  36.07 
 
 		 407 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  36.07 
 
 		 407 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  32.81 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3982  hypothetical protein  31.78 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.496896  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1704  hypothetical protein  28.95 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>