25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3253 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3253  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  340  9e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000796104  hitchhiker  0.00083693 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  45.03 
 
 		 180 aa  84.3  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  46.85 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  38.46 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  37.5 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2223  methylamine utilisation MauE  41.94 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4471  hypothetical protein  44.23 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  40.38 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  43.12 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  43.12 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  42.2 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4996  hypothetical protein  46.15 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.351525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  34.65 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  33.02 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  34.65 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5223  hypothetical protein  42.2 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  41.13 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  34.02 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  39.18 
 
 		 228 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  31.93 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3810  hypothetical protein  41.82 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  29.86 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3581  methylamine utilisation MauE  44.36 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  31.58 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0159  hypothetical protein  32.14 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>