28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2280 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2280  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  360  7.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  43.48 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  32.67 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  31.11 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  35.57 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  29.14 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1461  hypothetical protein  32.58 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  33.81 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  29.31 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  35 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  33.61 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  29.89 
 
 		 192 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  33.33 
 
 		 450 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  27.01 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  33.81 
 
 		 153 aa  47.8  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  28.68 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  28.79 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  27.13 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  27.13 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  30.43 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  27.13 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  31.4 
 
 		 138 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  31.97 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  31.29 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  31.54 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  28.12 
 
 		 139 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  24.63 
 
 		 190 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>