More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1920 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1920  patatin  100 
 
 		 277 aa  541  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  39.93 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  39.21 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  39.21 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  38.36 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  34.32 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  37.93 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  37.42 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  38.91 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  37.82 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  38.18 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2204  hypothetical protein  40.51 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  36.24 
 
 		 345 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  39.72 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  35.29 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  35.79 
 
 		 390 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  34.3 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  31.65 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  31.63 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  34.92 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  33.99 
 
 		 343 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  36.71 
 
 		 327 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  34.03 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  34.87 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  33.68 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  33.11 
 
 		 354 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  32.41 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  40.66 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  32.76 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  36.08 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3127  patatin  35.79 
 
 		 344 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  33.75 
 
 		 323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  31.16 
 
 		 292 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  32.42 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  32.25 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  32.2 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  32.42 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  32.42 
 
 		 314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  32.42 
 
 		 314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  32.42 
 
 		 314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  31.34 
 
 		 292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  32.42 
 
 		 314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  32.06 
 
 		 316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  34.25 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  34.49 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  32.2 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  32.2 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  31.51 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  31.33 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  31.43 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  30.29 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  30.29 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  30.29 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  41.9 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  30.29 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  30.29 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  34.39 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  30.29 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  29.93 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  32.88 
 
 		 352 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  31.92 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  31.02 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2826  patatin-like phospholipase family protein  31.23 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  32.2 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  30.29 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  29.19 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  29.19 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  34.15 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  34.36 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0488  patatin  29.43 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  29.56 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  34.22 
 
 		 315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  34.22 
 
 		 315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  34.22 
 
 		 315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  34.22 
 
 		 315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  30.29 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  28.47 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  40.22 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  36.84 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2188  putative phospholipase  29.76 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  36.04 
 
 		 317 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  36.04 
 
 		 317 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  30.6 
 
 		 352 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2451  patatin  29.97 
 
 		 343 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  31.23 
 
 		 351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30.56 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4504  patatin  33.68 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  42.31 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  35.97 
 
 		 373 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  30.22 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  35.04 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  32.45 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  30.84 
 
 		 352 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  35.04 
 
 		 320 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1595  patatin  31.56 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.613745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>