189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1359 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1359  CutA1 divalent ion tolerance protein  100 
 
 		 103 aa  201  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458665  normal  0.151703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2702  CutA1 divalent ion tolerance protein  50.98 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  48 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  48 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3199  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.16 
 
 		 108 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1378  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.94 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897354  normal  0.0284083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.94 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4157  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.24 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0548  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.57 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5027  CutA1 divalent ion tolerance protein  48 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.739286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  46 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31390  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  39.39 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2158  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.9 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.890158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4326  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.84 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0385  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.52 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.331799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.96 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0040  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.54 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.12 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.45 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.88 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9065  hypothetical protein  46.53 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0483  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.6 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0519  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.52 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0812329  normal  0.323933 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  47.42 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.63 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0342  periplasmic cytochrome biogenesis protein  46 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3298  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.21 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6084  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.52 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24332  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  50.96 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3135  CutA1 divalent ion tolerance protein  45 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00931834  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  50 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  45 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05051  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.74 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0443874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0785  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.58 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0689  putative divalent cation tolerance protein  40.62 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  43 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2603  periplasmic divalent cation tolerance protein  45 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3748  periplasmic divalent cation tolerance protein  45 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_1133  CutA1 divalent ion tolerance protein  49.38 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  43 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3141  periplasmic divalent cation tolerance protein  45 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1952  periplasmic divalent cation tolerance protein  45 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3718  divalent cation tolerance family protein  45 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3776  divalent cation tolerance family protein  45 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.930326  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_3506  periplasmic divalent cation tolerance protein  45 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3616  CutA1 divalent ion tolerance protein  45 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00421644  hitchhiker  0.000000032142 
 
 
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NC_013159  Svir_00920  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  45 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009051  Memar_1912  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.9 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008553  Mthe_0011  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.49 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.41 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_1688  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_2261  periplasmic divalent cation tolerance protein  42.55 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.155745  normal  0.159586 
 
 
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NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  44 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2482  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.3 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.634613  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.35 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5355  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.56 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1621  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.58 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.178296  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.86 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.71 
 
 		 114 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0539  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  46 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00953533  decreased coverage  0.00314697 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.25 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1690  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.58 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0635803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0037  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.78 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0036  CutA1 divalent ion tolerance protein  38 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3040  periplasmic divalent cation tolerance protein  43 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.994008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0665  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.75 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0333  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.35 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  51 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1673  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.12 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.478718  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07401  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.24 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.37 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1739  hypothetical protein  36.73 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3194  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2844  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.62 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0080  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.16 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0828  periplasmic divalent cation tolerance protein  33.33 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3521  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.62 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  42 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3115  divalent cation tolerance protein  32.65 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0820083  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.2 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.4 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3226  CutA1 divalent ion tolerance protein  41 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508585  normal  0.268666 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0954  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  40.62 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4155  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.43 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000487398  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2991  periplasmic divalent cation tolerance protein  42.16 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1797  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.71 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0716  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.1 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.737655  normal  0.575155 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1837  hypothetical protein  32.63 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.754917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1750  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.89 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3269  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.58 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.011597 
 
 
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NC_010531  Pnec_0078  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.24 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000144851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3007  hypothetical protein  41.35 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.46 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
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NC_004347  SO_0697  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  40 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008819  NATL1_05621  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.63 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.434314  normal  0.515801 
 
 
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NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.61 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
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NC_002936  DET1589  divalent cation tolerance protein CutA  39 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_5019  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.83 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71595  n/a   
 
 
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