42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34070 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34070  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 		 328 aa  673    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4192  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  65.22 
 
 		 331 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4214  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  63.82 
 
 		 312 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.885142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4280  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  63.82 
 
 		 312 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3466  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  65.23 
 
 		 312 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4441  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  63.49 
 
 		 312 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10235  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  62.78 
 
 		 314 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3061  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  63.58 
 
 		 312 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0486653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4495  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  58.63 
 
 		 324 aa  352  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265402  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  41.84 
 
 		 308 aa  242  7.999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0133  ribonucleotide reductase  42.62 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.01 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1973  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.37 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0182358  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3780  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  41.61 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.123752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0745  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  40.49 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5125  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  28.22 
 
 		 302 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653993  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0835  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  27.3 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  29.15 
 
 		 306 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3412  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  26.12 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  29.55 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4450  ribonucleotide reductase  31 
 
 		 320 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2539  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  26.67 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  27.19 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1227  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.57 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.569961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4387  ribonucleoside-diphosphate reductase  23.08 
 
 		 350 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3292  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.41 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2041  Ribonucleoside-diphosphate reductase  27.64 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4876  ribonucleoside-diphosphate reductase  25.23 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0013  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  19.78 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2574  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.01 
 
 		 342 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21930  ribonucleotide reductase, beta subunit  27.15 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1715  Ribonucleoside-diphosphate reductase  21.96 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  25.56 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0430  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.3 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1725  ribonucleoside-diphosphate reductase  26.38 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6268  Ribonucleoside-diphosphate reductase  26.64 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0689361 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2355  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  20.97 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2670  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  20.97 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3460  amino acid adenylation  22.33 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5565  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.38 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0535  hypothetical protein  19.73 
 
 		 355 aa  42.7  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4295  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  20.62 
 
 		 416 aa  42.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.958774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>