53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31010 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31010  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.424305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4167  protein of unknown function DUF343  74.55 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6326  protein of unknown function DUF343  63.33 
 
 		 63 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0899  hypothetical protein  63.16 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0245559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6009  hypothetical protein  59.32 
 
 		 73 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0181193  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  59.32 
 
 		 66 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  52.54 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4297  protein of unknown function DUF343  56.36 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.925532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0752  hypothetical protein  44.78 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  40.58 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  57.89 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  54.24 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  54.24 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  49.15 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  38.24 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  41.43 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  39.06 
 
 		 58 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  50.82 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  41.67 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  43.1 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  45.61 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  40.68 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  45.31 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  45.9 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0488  protein of unknown function DUF343  35 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  47.27 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  47.27 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  43.1 
 
 		 71 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  47.27 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  44.83 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  46.55 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  43.64 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  44.83 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  44.83 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  44.83 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  44.83 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  44.83 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  44.83 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  44.83 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  44.83 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  44.83 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  44.83 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  38.98 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2640  protein of unknown function DUF343  45.45 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  42.37 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  42.37 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1297  acetoacetyl-CoA reductase  44.64 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199005  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  43.1 
 
 		 64 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  47.37 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  43.1 
 
 		 64 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  43.1 
 
 		 64 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  40.68 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2257  hypothetical protein  42.37 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>