53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29150 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  100 
 
 		 192 aa  362  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  53.37 
 
 		 211 aa  184  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  52.25 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  51.15 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  44.88 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  51.52 
 
 		 229 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  51.52 
 
 		 229 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  51.52 
 
 		 229 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  48.91 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  44.69 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  42.31 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  47.59 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  48.89 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  41.08 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  43.33 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  41.41 
 
 		 238 aa  140  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  43.09 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  43.09 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  36.17 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  44.89 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  42.95 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  43.71 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  38.42 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  41.32 
 
 		 217 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  37.43 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  40.85 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  37.65 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  32.04 
 
 		 256 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  42.18 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  38.89 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  37.93 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  43.04 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  42.48 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  41.18 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  44.17 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  40.51 
 
 		 184 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  32.52 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  45.45 
 
 		 211 aa  92  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  34.3 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  29.48 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  30.06 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  37.36 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  37.6 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  33.59 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3385  rhomboid family protein  36.65 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  32.37 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2256  rhomboid-like protein  27.61 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0526301 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  31.36 
 
 		 487 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  35.86 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  31.36 
 
 		 487 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  36.14 
 
 		 306 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.13 
 
 		 486 aa  42.4  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  30.46 
 
 		 248 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>