30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  919    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1292  hypothetical protein  61.43 
 
 		 447 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1116  hypothetical protein  62.3 
 
 		 436 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  52.24 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7035  hypothetical protein  47.51 
 
 		 499 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0080  hypothetical protein  46.77 
 
 		 461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0998986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8662  hypothetical protein  46.64 
 
 		 466 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0602  hypothetical protein  46.07 
 
 		 469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0122  replication initiation protein  48.82 
 
 		 478 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4534  hypothetical protein  44.07 
 
 		 474 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4126  putative replication initiation protein  39.46 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4162  putative replication initiation protein  41.22 
 
 		 492 aa  263  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0471943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2106  putative replication initiation protein  40.62 
 
 		 478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.612009  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4088  putative replication initiation protein  39.56 
 
 		 476 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4273  putative plasmid replication initiator protein  37.68 
 
 		 506 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1580  putative plasmid replication initiator protein  36.38 
 
 		 521 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0635  hypothetical protein  35.48 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3399  putative replication initiation protein  36.79 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00332315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3035  putative plasmid replication initiator protein  34.11 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3178  putative plasmid replication initiator protein  34.05 
 
 		 499 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3228  putative plasmid replication initiator protein  34.05 
 
 		 499 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00604715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3166  putative plasmid replication initiator protein  34.05 
 
 		 499 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40822  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5992  plasmid replication initiator protein  35.06 
 
 		 197 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679906  hitchhiker  0.0000578035 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5591  plasmid replication initiator protein  35.06 
 
 		 197 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0150  hypothetical protein  25.13 
 
 		 577 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0404  hypothetical protein  31.2 
 
 		 476 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  30.08 
 
 		 550 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0922  hypothetical protein  33.06 
 
 		 527 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0041  hypothetical protein  31.67 
 
 		 552 aa  43.1  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5522  replication initiator protein  30.89 
 
 		 569 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0195674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>