More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23320 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  100 
 
 
322 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2364  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.01 
 
 
321 aa  394  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.53 
 
 
323 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  60.8 
 
 
324 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  61.11 
 
 
324 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.06 
 
 
324 aa  356  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  59.26 
 
 
323 aa  354  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1523  alcohol dehydrogenase  62.65 
 
 
333 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0659671  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1554  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.73 
 
 
333 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1577  alcohol dehydrogenase  61.73 
 
 
333 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1858  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.8 
 
 
320 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.75 
 
 
331 aa  325  7e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0130  alcohol dehydrogenase  57.59 
 
 
320 aa  318  9e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  54.04 
 
 
321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.04 
 
 
321 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  54.04 
 
 
321 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  51.71 
 
 
320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  45.85 
 
 
325 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  45.96 
 
 
325 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
326 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  45.23 
 
 
325 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.54 
 
 
325 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0107  alcohol dehydrogenase  52.65 
 
 
322 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.44 
 
 
328 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  44 
 
 
325 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.31 
 
 
325 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  43.08 
 
 
325 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.96 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  45.99 
 
 
324 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  42.46 
 
 
325 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 
325 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  43.48 
 
 
324 aa  238  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.34 
 
 
322 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10150  quinone oxidoreductase  48.76 
 
 
322 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.04 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  44.85 
 
 
334 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.1 
 
 
325 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 
324 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 
324 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  43.34 
 
 
324 aa  225  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
333 aa  225  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  43.54 
 
 
337 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0870  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.06 
 
 
319 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.61 
 
 
324 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.69 
 
 
319 aa  218  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.49 
 
 
324 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.94 
 
 
327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 
324 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.49 
 
 
324 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.11 
 
 
324 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.41 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.98 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.56 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 
335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  42.9 
 
 
331 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.3 
 
 
361 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  39.75 
 
 
319 aa  209  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.78 
 
 
324 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.01 
 
 
324 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  42.28 
 
 
326 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  41.93 
 
 
324 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  43.44 
 
 
326 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.92 
 
 
326 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  36.81 
 
 
328 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.99 
 
 
324 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  43.44 
 
 
326 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  42.47 
 
 
340 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.81 
 
 
328 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  36.81 
 
 
328 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  40.99 
 
 
324 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.81 
 
 
328 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
326 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.81 
 
 
326 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  36.5 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  45.93 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.76 
 
 
335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.2 
 
 
328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  43.75 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 
329 aa  199  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.51 
 
 
325 aa  198  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  36.5 
 
 
328 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  36.5 
 
 
328 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 
324 aa  198  9e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.36 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4130  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.81 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  42.5 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  38.82 
 
 
323 aa  196  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.95 
 
 
325 aa  195  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.79 
 
 
326 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.09 
 
 
324 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 
326 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 
326 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
324 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  40.56 
 
 
323 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1917  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.9 
 
 
336 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.820902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.7 
 
 
324 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>