23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18060  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 234 aa  453  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28460  ABC-2 type transporter  40.52 
 
 		 245 aa  158  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1630  ABC-2 type transporter  36.06 
 
 		 276 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68052  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30630  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.07 
 
 		 273 aa  118  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.4 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0475  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0589  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 375 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1056  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.655499  normal  0.0850571 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 286 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 281 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 286 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0505  ABC-2 type transporter  20.94 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000955112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25.13 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  26.29 
 
 		 263 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 280 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.51 
 
 		 284 aa  41.6  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 252 aa  41.6  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  34.94 
 
 		 313 aa  41.6  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>