More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06160 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  100 
 
 
288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  77.53 
 
 
285 aa  408  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  57.99 
 
 
307 aa  338  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  61.7 
 
 
296 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  61.7 
 
 
296 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  61.7 
 
 
296 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  59.29 
 
 
301 aa  331  8e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  58.42 
 
 
297 aa  320  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  59.22 
 
 
291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  57.4 
 
 
291 aa  316  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  54.48 
 
 
305 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  58.67 
 
 
310 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  53.96 
 
 
303 aa  278  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  57.71 
 
 
326 aa  268  8.999999999999999e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  49.82 
 
 
301 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  39.44 
 
 
281 aa  143  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  34.73 
 
 
308 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
311 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
311 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
312 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
314 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  27.21 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
336 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 
329 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
306 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  30.4 
 
 
339 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
318 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  30.4 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  26.5 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
401 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  32.95 
 
 
907 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
318 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  29.8 
 
 
318 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
340 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
324 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
293 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
318 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
334 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
329 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
324 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
294 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
327 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  32.7 
 
 
275 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
313 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
287 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
282 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  25.79 
 
 
296 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
325 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  25.48 
 
 
652 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
318 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
290 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
318 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
360 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
298 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
304 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
286 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
334 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  30.48 
 
 
884 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
247 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
277 aa  99.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 
298 aa  99  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  27.49 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
336 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.01 
 
 
379 aa  97.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
334 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
306 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 
312 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
557 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
310 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
705 aa  95.9  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.72 
 
 
311 aa  95.9  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
289 aa  95.9  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.4 
 
 
355 aa  95.5  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
317 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
290 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
275 aa  92.8  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
288 aa  92.8  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
341 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
299 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  27.17 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4373  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  27.8 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
359 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
841 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
1739 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>