More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0908 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0908  elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  390  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  61.7 
 
 		 187 aa  243  9e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  60.22 
 
 		 189 aa  241  6e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  59.14 
 
 		 189 aa  238  4e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  59.14 
 
 		 189 aa  238  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  59.14 
 
 		 189 aa  238  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  60.75 
 
 		 188 aa  236  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  59.68 
 
 		 189 aa  236  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  60.77 
 
 		 187 aa  230  8.000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  58.01 
 
 		 188 aa  228  4e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  45.41 
 
 		 190 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  45.41 
 
 		 190 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  45.41 
 
 		 190 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  44.57 
 
 		 186 aa  174  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  45.78 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  47.37 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  46.47 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  43.32 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  42.02 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  46.01 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  43.48 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  41.85 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  41.49 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  44.86 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  45.3 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  42.78 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  43.17 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  43.17 
 
 		 185 aa  160  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  45.45 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  41.4 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  38.17 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  39.89 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  41.85 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  42.94 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  39.04 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  37.97 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  39.47 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  39.36 
 
 		 189 aa  155  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  44.17 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1576  elongation factor P  40.96 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  38.83 
 
 		 189 aa  154  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  39.36 
 
 		 189 aa  154  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  39.36 
 
 		 189 aa  154  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  44.89 
 
 		 187 aa  154  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  38.3 
 
 		 188 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  40.43 
 
 		 188 aa  154  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  40.44 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  41.11 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  39.68 
 
 		 190 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  42.39 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  37.23 
 
 		 188 aa  151  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1633  elongation factor P  40.96 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  41.99 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  38.83 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  38.83 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  42.22 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  43.32 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  40.78 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  41.4 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  39.04 
 
 		 187 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  39.56 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  37.57 
 
 		 191 aa  147  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  39.56 
 
 		 187 aa  147  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  37.63 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  40.68 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  39.89 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  41.71 
 
 		 187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  45.68 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  38.3 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0011  elongation factor P  39.34 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000591354  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  37.77 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  39.34 
 
 		 187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  43.65 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  39.66 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  40.21 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  37.77 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  41.11 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>