69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3676 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  100 
 
 
271 aa  554  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  88.85 
 
 
269 aa  501  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  64.02 
 
 
280 aa  344  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3814  amidinotransferase  61.69 
 
 
285 aa  323  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  60.54 
 
 
292 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0780  amidinotransferase  58.96 
 
 
275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  60.08 
 
 
278 aa  317  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1169  amidinotransferase  60.08 
 
 
278 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.730709  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03350  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  60.45 
 
 
270 aa  311  5.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  58.11 
 
 
281 aa  310  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  58.15 
 
 
272 aa  309  2.9999999999999997e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  58.62 
 
 
264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2244  amidinotransferase  59.09 
 
 
276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.510972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  59.32 
 
 
279 aa  301  9e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2664  amidinotransferase  56.77 
 
 
273 aa  299  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30700  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  55.68 
 
 
279 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  56.47 
 
 
302 aa  295  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  55.6 
 
 
290 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  54.07 
 
 
272 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  54.07 
 
 
272 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  54.07 
 
 
272 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2012  amidinotransferase  55.43 
 
 
318 aa  288  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  54.96 
 
 
680 aa  288  7e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  55.89 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4529  amidinotransferase  53.56 
 
 
269 aa  276  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  52.96 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5039  amidinotransferase  54.34 
 
 
277 aa  271  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  55 
 
 
356 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  48.29 
 
 
268 aa  228  7e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.83 
 
 
705 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  38.2 
 
 
703 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  36.7 
 
 
703 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  38.2 
 
 
704 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  36.9 
 
 
703 aa  168  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  35.96 
 
 
705 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  35.96 
 
 
705 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  39.85 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0382  amidinotransferase family protein  36.4 
 
 
275 aa  158  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0222666  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1814  amidinotransferase family protein  36.4 
 
 
275 aa  158  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3467  amidinotransferase  38.27 
 
 
294 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.501017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  36.23 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  34.53 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  22.51 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  27.57 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  25.75 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5166  amidinotransferase  28.69 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  24.91 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  28.4 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  20.85 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  24.09 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  25.62 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  25.73 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  25.63 
 
 
256 aa  62  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  22.18 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  22.59 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  23.65 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  29.79 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  27.76 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  23.85 
 
 
263 aa  55.8  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  25.62 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  24.9 
 
 
261 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  21.43 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  26.71 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  25.34 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2108  amidinotransferase  25.1 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  25 
 
 
419 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  23.68 
 
 
407 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  24.79 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5027  arginine deiminase  26.27 
 
 
436 aa  42.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0721497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>