26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2732 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2732  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  719    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000236049  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  34.02 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  36.86 
 
 
260 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  32.05 
 
 
239 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  39.31 
 
 
260 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  29.73 
 
 
237 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  27.85 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  34.11 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  31.82 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1051  hypothetical protein  35.53 
 
 
223 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  27.64 
 
 
214 aa  59.7  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  35.92 
 
 
219 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  27.05 
 
 
212 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  29.38 
 
 
227 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2320  hypothetical protein  29.56 
 
 
246 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  25.33 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  31.16 
 
 
275 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  31.3 
 
 
238 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  29.01 
 
 
280 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  24.71 
 
 
217 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  24.14 
 
 
217 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  24.14 
 
 
217 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  24.14 
 
 
217 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  24.14 
 
 
217 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  24.14 
 
 
217 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  29.32 
 
 
223 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>