More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2081 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2081  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
520 aa  1035    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312551  normal  0.0895678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1690  glycosyl transferase family protein  52.44 
 
 
518 aa  498  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0342764  hitchhiker  0.00101578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1692  glycosyl transferase family protein  51.46 
 
 
518 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26500  glycosyl transferase  36.39 
 
 
632 aa  186  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  37.65 
 
 
637 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  36.36 
 
 
672 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2173  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.65 
 
 
662 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
573 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
573 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  30.4 
 
 
1157 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  28 
 
 
1173 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0511  family 2 glycosyl transferase  29.58 
 
 
586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.287818  normal  0.265278 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14580  glycosyl transferase  29.26 
 
 
636 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  29.49 
 
 
353 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  33.2 
 
 
616 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  28.69 
 
 
321 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1424  glycosyltransferase-like protein  29.77 
 
 
385 aa  100  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
366 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2178  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  33.82 
 
 
952 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.32 
 
 
1148 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  32.07 
 
 
341 aa  99  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  35.65 
 
 
731 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  32.92 
 
 
785 aa  97.8  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  32.74 
 
 
946 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.12 
 
 
322 aa  97.1  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
335 aa  96.7  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 
384 aa  96.3  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
324 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  27.62 
 
 
333 aa  94.7  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
1116 aa  94.7  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2437  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
357 aa  94  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  33.2 
 
 
941 aa  93.6  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.71 
 
 
326 aa  93.2  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.12 
 
 
1168 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31.63 
 
 
970 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
376 aa  90.1  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3087  family 2 glycosyl transferase  33.15 
 
 
650 aa  90.1  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147909  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
760 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  40.71 
 
 
344 aa  89  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  25.94 
 
 
325 aa  89.4  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  34.78 
 
 
729 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.22 
 
 
326 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  46.23 
 
 
1032 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.75 
 
 
350 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  30.26 
 
 
1169 aa  87.4  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.78 
 
 
326 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  39.82 
 
 
344 aa  86.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  39.82 
 
 
344 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  27.49 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  39.82 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  39.82 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  38.84 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  37.08 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  39.82 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.78 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  39.82 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.75 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  40.68 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  30.13 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0640  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
329 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  38.94 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  30.18 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  26.27 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  26.27 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0959  Cps2I  27.57 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  22.35 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  25.97 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  35.88 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  36.75 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  26.27 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 
369 aa  79.7  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  40.54 
 
 
344 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.07 
 
 
329 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3457  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2094  glycosyl transferase family 2  42.72 
 
 
334 aa  79  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
329 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0456  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
370 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
309 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
341 aa  79  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1821  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 
345 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000034803  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8518  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  26.86 
 
 
658 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0853997  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  26.02 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  26.48 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2037  glycosyl transferase family 2  44.33 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.537056 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
334 aa  77  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0431  putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC  44.09 
 
 
1636 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.25 
 
 
254 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  27.35 
 
 
386 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0842  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
347 aa  76.3  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.752789  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.26 
 
 
340 aa  76.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>