More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0456 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0456  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
370 aa  734    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
1116 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  40.65 
 
 
1157 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  41.48 
 
 
785 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  42.54 
 
 
1173 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  46.7 
 
 
616 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  46.02 
 
 
1168 aa  176  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  39.27 
 
 
1169 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1197  glycosyl transferase family 2  42.92 
 
 
358 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0797043  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  35.06 
 
 
1148 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  36.07 
 
 
946 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  36.94 
 
 
941 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2178  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  33.98 
 
 
952 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27900  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  36.59 
 
 
1157 aa  136  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1210  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  32.64 
 
 
946 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255767  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.22 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  31.85 
 
 
349 aa  126  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  33.8 
 
 
321 aa  125  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  30.7 
 
 
346 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  34.82 
 
 
325 aa  124  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  29.28 
 
 
325 aa  122  8e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  34.25 
 
 
391 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  26.36 
 
 
353 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  39.82 
 
 
731 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
335 aa  115  7.999999999999999e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
376 aa  115  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  33.49 
 
 
327 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  29.15 
 
 
343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  37.85 
 
 
729 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.05 
 
 
328 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
351 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.57 
 
 
350 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
358 aa  106  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 
295 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
351 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  37.39 
 
 
334 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
553 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  45.26 
 
 
326 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.05 
 
 
380 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
398 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
329 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
329 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2886  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
329 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  51.04 
 
 
301 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2094  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
334 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  31.36 
 
 
341 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  30.14 
 
 
970 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  33.94 
 
 
672 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 
357 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  45.26 
 
 
326 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  27.9 
 
 
332 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0582  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.86 
 
 
272 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  42.45 
 
 
347 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 
366 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  44.21 
 
 
326 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1227  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.62 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000982569  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  42.38 
 
 
347 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
341 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  43.75 
 
 
326 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  40.78 
 
 
295 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1282  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.48 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  48.94 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  46.79 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
348 aa  97.1  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 
295 aa  96.3  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.05 
 
 
322 aa  95.9  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  40.87 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
322 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  47.78 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  46.79 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.44 
 
 
275 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  48.35 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  42.11 
 
 
326 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  38.03 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  46.3 
 
 
330 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 
342 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  45.28 
 
 
230 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2037  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
369 aa  94  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.537056 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  42.45 
 
 
337 aa  93.6  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  47.83 
 
 
390 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1821  glycosyl transferase family 2  32.51 
 
 
345 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000034803  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
289 aa  93.2  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  47.83 
 
 
1032 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1433  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.5 
 
 
340 aa  92.8  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1126  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.463481  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 
324 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2081  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
520 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312551  normal  0.0895678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  27.88 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  44.57 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  21.56 
 
 
306 aa  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  33.62 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  38.53 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>