21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1061 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1061  hypothetical protein  100 
 
 
1222 aa  2456    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05163  hypothetical protein  35.38 
 
 
1171 aa  679    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0660  hypothetical protein  33.36 
 
 
1171 aa  616  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3079  OmpA/MotB domain-containing protein  27.51 
 
 
1700 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0436  OmpA/MotB domain protein  27.64 
 
 
1709 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2392  OmpA/MotB  28.04 
 
 
1402 aa  399  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0046  hypothetical protein  27.89 
 
 
1260 aa  383  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2415  hypothetical protein  27.89 
 
 
1260 aa  383  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633946  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3574  hypothetical protein  25.89 
 
 
1140 aa  312  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3404  hypothetical protein  25.11 
 
 
1175 aa  281  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24888  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3669  hypothetical protein  24.89 
 
 
1175 aa  278  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  22.93 
 
 
2000 aa  122  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  22.43 
 
 
1984 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  24.68 
 
 
2118 aa  94  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  22.67 
 
 
2233 aa  92  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1861  hypothetical protein  21.98 
 
 
1143 aa  89.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.701379  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  23.09 
 
 
1278 aa  85.5  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  24.05 
 
 
2418 aa  60.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  25.92 
 
 
1757 aa  61.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  26.56 
 
 
1702 aa  53.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  23.27 
 
 
2434 aa  49.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>