More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1069 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 574 aa  1174    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 566 aa  708    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 570 aa  537  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 570 aa  525  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 570 aa  523  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 570 aa  520  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 588 aa  477  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 569 aa  462  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 564 aa  427  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 555 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 561 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 555 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 569 aa  412  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 561 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 560 aa  398  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 555 aa  398  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 		 562 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 561 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 557 aa  378  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 634 aa  365  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 573 aa  361  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 582 aa  341  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 574 aa  338  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 579 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 590 aa  327  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 569 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 569 aa  220  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 568 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 555 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 587 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 799 aa  213  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 563 aa  211  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 552 aa  211  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 570 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 556 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 561 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 556 aa  205  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 580 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 816 aa  204  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1300  glutaminyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 794 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.91877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 565 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 557 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39738  predicted protein  34.8 
 
 		 749 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 555 aa  202  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 565 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 565 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 555 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 552 aa  200  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 		 548 aa  199  7.999999999999999e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  29.89 
 
 		 858 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0814  glutaminyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 597 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000834243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  29.42 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.450969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89978  glutamine-tRNA ligase  31.26 
 
 		 720 aa  199  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.220095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 556 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1755  glutaminyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 802 aa  198  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 		 556 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  31.23 
 
 		 554 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0665  glutaminyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 		 579 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0340381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 565 aa  197  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 559 aa  196  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 		 554 aa  196  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 		 556 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  31.03 
 
 		 554 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 554 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 554 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 554 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 568 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 554 aa  196  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 554 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 554 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 556 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 556 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 556 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 556 aa  194  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 		 555 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 551 aa  194  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 569 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 565 aa  193  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 		 555 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 		 552 aa  193  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0094  glutaminyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 556 aa  193  7e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 		 555 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 		 555 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 596 aa  193  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 569 aa  193  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 		 555 aa  193  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 569 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 558 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 569 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 569 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 569 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 569 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>