20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4024 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  100 
 
 		 620 aa  1302    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  32.3 
 
 		 790 aa  343  7e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  26.75 
 
 		 657 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  30.06 
 
 		 618 aa  239  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  28.33 
 
 		 620 aa  239  9e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  28.55 
 
 		 626 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  28.8 
 
 		 631 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  27.67 
 
 		 620 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1461  hypothetical protein  26.35 
 
 		 709 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1870  hypothetical protein  22.97 
 
 		 949 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00747265  normal  0.613683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  23.22 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4117  hypothetical protein  23.4 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0456  hypothetical protein  23.43 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4026  hypothetical protein  22.93 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0537  cytochrome c family protein  27.03 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.896583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  24.15 
 
 		 1344 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  22.08 
 
 		 1532 aa  67  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  20.88 
 
 		 1432 aa  63.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1504  hypothetical protein  20.77 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1198  hypothetical protein  22.51 
 
 		 418 aa  44.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>