57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0577 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4384  major facilitator transporter  77.72 
 
 		 418 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0577  major facilitator transporter  100 
 
 		 413 aa  818    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0539  transporter, putative  73.12 
 
 		 420 aa  598  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0535  major facilitator transporter  74.33 
 
 		 422 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0537  major facilitator transporter  74.45 
 
 		 420 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0420  major facilitator transporter  75.36 
 
 		 410 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3814  major facilitator transporter  70.66 
 
 		 412 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3494  major facilitator transporter  74.15 
 
 		 420 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1224  major facilitator transporter  70.66 
 
 		 412 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2329  major facilitator transporter  70.9 
 
 		 412 aa  571  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.567162  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3735  major facilitator transporter  71.32 
 
 		 404 aa  566  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0495  major facilitator transporter  73.43 
 
 		 422 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4001  major facilitator transporter  69.29 
 
 		 405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3955  major facilitator transporter  73.06 
 
 		 422 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3829  major facilitator transporter  73.06 
 
 		 422 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1849  major facilitator transporter  69.29 
 
 		 408 aa  548  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.111445  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00294  nitric oxide reductase cytochrome b subunit  67 
 
 		 405 aa  546  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002128  permease  67.74 
 
 		 405 aa  545  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3773  major facilitator superfamily MFS_1  72.33 
 
 		 422 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1523  major facilitator transporter  70.62 
 
 		 408 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0466428  normal  0.689457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5151  major facilitator transporter  70.02 
 
 		 410 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.385691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3550  major facilitator transporter  70.32 
 
 		 414 aa  525  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.013577  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0589  putative transporter  67.82 
 
 		 411 aa  527  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3636  major facilitator superfamily transporter  68.26 
 
 		 403 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2816  MFS transporter  66.58 
 
 		 416 aa  521  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3354  hypothetical protein  66.83 
 
 		 402 aa  511  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.787114  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3635  major facilitator transporter  63.11 
 
 		 408 aa  510  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0495  transporter, putative  68.72 
 
 		 403 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1866  major facilitator transporter  62.4 
 
 		 398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0139622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1481  major facilitator transporter  61.92 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1923  major facilitator superfamily MFS_1  59.5 
 
 		 411 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.861056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2971  major facilitator transporter  59.9 
 
 		 403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2313  major facilitator transporter  53.94 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1225  major facilitator transporter  54.42 
 
 		 432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3332  major facilitator transporter  56.25 
 
 		 411 aa  442  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1346  major facilitator superfamily MFS_1  58.08 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.170825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1534  major facilitator superfamily MFS_1  54.81 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0444  major facilitator superfamily permease  53.88 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11561  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  53.88 
 
 		 420 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0178194 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0724  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  52.67 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3273  major facilitator transporter  53.68 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335805  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  52.91 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3714  major facilitator transporter  54.61 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0668  major facilitator superfamily MFS_1  52.67 
 
 		 420 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.453305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1845  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  53.77 
 
 		 416 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0634224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11061  multidrug efflux transporter, MFS family protein  52.43 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3677  major facilitator superfamily MFS_1  52.48 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.650298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1940  putative membrane transporter  53.37 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.675195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3961  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 419 aa  332  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.588291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1585  putative membrane transporter  47.04 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0524  major facilitator transporter  49.25 
 
 		 424 aa  316  6e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.181253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1255  major facilitator superfamily MFS_1  48.5 
 
 		 422 aa  311  9e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0896974  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1643  major facilitator transporter  48.54 
 
 		 409 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1851  major facilitator superfamily MFS_1  47.82 
 
 		 443 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0650056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1412  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4212  putative multidrug-efflux transporter  48.14 
 
 		 412 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30287  MFS family transporter: multidrug efflux  38.33 
 
 		 454 aa  258  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>