150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5997 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5997  Proline racemase  100 
 
 		 336 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2317  Proline racemase  58.5 
 
 		 338 aa  355  7.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2251  proline racemase  52.42 
 
 		 335 aa  321  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0642  proline racemase  44.31 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0802  proline racemase  41.06 
 
 		 331 aa  252  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0989  putative proline racemase  41.06 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0799  proline racemase  41.69 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0800  proline racemase  41.23 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4388  putative proline racemase  41.11 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  1.6490700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1082  putative proline racemase  41.98 
 
 		 334 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0853  proline racemase  41.35 
 
 		 331 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0901  proline racemase  41.35 
 
 		 331 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.699009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0994  proline racemase, putative  41.11 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0943  putative proline racemase  41.11 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0120446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1453  putative proline racemase  40.87 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1763  proline racemase  42.9 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000615926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2361  proline racemase  43.52 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000418015  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1532  putative proline racemase  42.2 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3344  proline racemase  43.23 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0227164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1024  putative proline racemase  42.49 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0744753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2259  proline racemase  39.13 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755409  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5694  proline racemase  42.2 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1705  proline racemase  39.53 
 
 		 346 aa  225  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4243  proline racemase  42.77 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000241278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1660  proline racemase  42.2 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137069  normal  0.0715412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4007  proline racemase  42.77 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4360  proline racemase  42.77 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3769  proline racemase  42.49 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00125754  normal  0.197113 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2821  proline racemase  42.41 
 
 		 346 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5994  proline racemase  42.49 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4260  proline racemase  42.44 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6004  4-hydroxyproline epimerase  39.31 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.0460941 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1045  proline racemase  34.29 
 
 		 340 aa  193  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0460  Proline racemase  36.63 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2840  putative proline racemase  34.1 
 
 		 345 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000647776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31580  proline racemase  38.6 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2643  proline racemase  33.82 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2834  proline racemase  33.82 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2559  proline racemase  33.82 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2594  proline racemase  33.82 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2885  putative proline racemase  33.53 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4111  Proline racemase  36.55 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3503  Proline racemase  37.28 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2637  proline racemase  33.24 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2846  putative proline racemase  32.94 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2447  putative proline racemase  32.56 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3519  putative proline racemase  36.07 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.235332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5915  proline racemase  36.26 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3164  proline racemase  36.07 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1690  proline racemase  35.55 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4722  proline racemase  36.42 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2823  hydroxyproline-2-epimerase  33.33 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  normal  0.582579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2363  hydroxyproline-2-epimerase  34.12 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00996894  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1761  hydroxyproline-2-epimerase  33.53 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000415144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5265  hydroxyproline-2-epimerase  34.38 
 
 		 338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1419  hydroxyproline-2-epimerase  34.31 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0468879  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_004310  BR1792  hydroxyproline-2-epimerase  34.4 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1726  hydroxyproline-2-epimerase  34.4 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.716077  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1111  hydroxyproline-2-epimerase  34.01 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920734  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3863  hydroxyproline-2-epimerase  33.14 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2863  proline racemase, putative  32.57 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1530  hydroxyproline-2-epimerase  33.53 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1703  hydroxyproline-2-epimerase  32.65 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2065  hydroxyproline-2-epimerase  34.49 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.012514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0498  proline racemase  33.53 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3837  proline racemase  34.9 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3228  hydroxyproline-2-epimerase  33.81 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3463  hydroxyproline-2-epimerase  40.19 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3966  proline racemase  35.67 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4859  hydroxyproline-2-epimerase  33.33 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5268  proline racemase  32.55 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3225  proline racemase  32.26 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.821364 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0298  hydroxyproline-2-epimerase  32.27 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.123258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1478  4-hydroxyproline epimerase  32.55 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.857006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0518  hypothetical protein  30.9 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0234  proline racemase  28.97 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02121  proline racemase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02000)  34.39 
 
 		 401 aa  153  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0070174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4273  hydroxyproline-2-epimerase  32.26 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0118  Proline racemase  31.87 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5285  hydroxyproline-2-epimerase  33.14 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103378  normal  0.295156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0107  proline racemase  31.58 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4845  proline racemase  32.26 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5572  hydroxyproline-2-epimerase  32.64 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000335762  normal  0.0993584 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7251  hydroxyproline-2-epimerase  32.84 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4841  hydroxyproline-2-epimerase  32.27 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003673  4-hydroxyproline epimerase  32.03 
 
 		 301 aa  143  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3467  hydroxyproline-2-epimerase  32.07 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1587  proline racemase  30.59 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1450  hydroxyproline-2-epimerase  29.87 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3975  proline racemase  34.69 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3320  proline racemase  30.7 
 
 		 336 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0052  proline racemase  30.09 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1529  proline racemase  30.57 
 
 		 346 aa  132  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0477377  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1840  proline racemase  30.7 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2641  proline racemase  27.71 
 
 		 342 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4667  proline racemase  33.24 
 
 		 344 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  0.66467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2705  proline racemase  31.76 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1184  proline racemase  28.32 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4137  hypothetical protein  28.12 
 
 		 344 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583896  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7022  hypothetical protein  29.34 
 
 		 342 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>