33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4667 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4667  transposase  100 
 
 		 123 aa  253  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  55.36 
 
 		 916 aa  125  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  59.38 
 
 		 838 aa  123  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  45.45 
 
 		 1028 aa  98.2  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0769  transposase Tn3 family protein  52.69 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  42.2 
 
 		 1006 aa  93.2  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  38.74 
 
 		 771 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  50 
 
 		 1075 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  33.61 
 
 		 492 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  39.64 
 
 		 991 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  39.64 
 
 		 991 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  33.33 
 
 		 997 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  33.64 
 
 		 612 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  29.2 
 
 		 1029 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  35.96 
 
 		 983 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  32.99 
 
 		 988 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  35.51 
 
 		 992 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  35.51 
 
 		 992 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  38.2 
 
 		 988 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  33.33 
 
 		 988 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  37.89 
 
 		 1015 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  34.69 
 
 		 988 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  34.69 
 
 		 988 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  32.18 
 
 		 988 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  32.18 
 
 		 988 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  30.91 
 
 		 738 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  31.73 
 
 		 988 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  31.73 
 
 		 988 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  31.73 
 
 		 988 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  30 
 
 		 992 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3677  hypothetical protein  30.93 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.472291 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  30.77 
 
 		 988 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  27.93 
 
 		 987 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>