264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3905 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3905  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
570 aa  1167    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504805  normal  0.221865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7195  putative glycosyl transferase  48.55 
 
 
888 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80662  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2257  putative transmembrane cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.96 
 
 
617 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
1231 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
620 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0207  putative cellulose synthase protein  32.11 
 
 
635 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.489481  normal  0.127812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
591 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4332  putative cellulose synthase protein  29.37 
 
 
622 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00407382  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.77 
 
 
586 aa  143  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4003  putative cellulose synthase protein  28.43 
 
 
622 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.06 
 
 
980 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4415  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.71 
 
 
616 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160191  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3671  putative cellulose synthase protein  30.65 
 
 
618 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484697  hitchhiker  0.0086159 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1333  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.32 
 
 
627 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  34.27 
 
 
880 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.14 
 
 
544 aa  136  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.02 
 
 
886 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  29.95 
 
 
564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1792  cellulose synthase-like protein  29.5 
 
 
627 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.643203 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  28.2 
 
 
650 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0158  cellulose synthase-like protein  29.29 
 
 
627 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  29.73 
 
 
712 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  29.18 
 
 
716 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0544  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.6 
 
 
614 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
547 aa  121  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.33 
 
 
503 aa  117  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  28.81 
 
 
741 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.79 
 
 
768 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  27.02 
 
 
778 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  26.37 
 
 
749 aa  103  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.67 
 
 
794 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  25.26 
 
 
737 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  25.96 
 
 
501 aa  100  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  25.87 
 
 
788 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.39 
 
 
845 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  29.39 
 
 
845 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1828  Cellulose synthase (UDP-forming)  35.79 
 
 
656 aa  97.8  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.3 
 
 
930 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3450  Cellulose synthase (UDP-forming)  34.01 
 
 
659 aa  97.1  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  26.08 
 
 
579 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.93 
 
 
743 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  25.28 
 
 
788 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  25.28 
 
 
788 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  26.93 
 
 
658 aa  95.1  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  28.33 
 
 
726 aa  95.5  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.06 
 
 
652 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  26.94 
 
 
652 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  28.63 
 
 
845 aa  94.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.24 
 
 
831 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.46 
 
 
810 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.59 
 
 
652 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.63 
 
 
846 aa  93.6  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  30.15 
 
 
683 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  27.62 
 
 
740 aa  92.8  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  27.23 
 
 
869 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.54 
 
 
845 aa  92.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.94 
 
 
822 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.44 
 
 
834 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  28.63 
 
 
845 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
1129 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  28.63 
 
 
845 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1116  cellulose synthase (UDP-forming)  31.62 
 
 
691 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.772245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  25.89 
 
 
867 aa  92  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.63 
 
 
845 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0406  cellulose synthase (UDP-forming)  36.11 
 
 
658 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0415  cellulose synthase (UDP-forming)  36.11 
 
 
658 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0394  cellulose synthase (UDP-forming)  36.11 
 
 
658 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193019  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  26.18 
 
 
514 aa  90.5  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  24.12 
 
 
707 aa  90.5  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
1140 aa  90.1  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  24.2 
 
 
874 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  27.52 
 
 
869 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  24.23 
 
 
739 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3768  cellulose synthase (UDP-forming)  35.87 
 
 
677 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.092957  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
917 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  24.2 
 
 
874 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  29 
 
 
729 aa  89.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
658 aa  90.1  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.17 
 
 
811 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  24.08 
 
 
872 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.08 
 
 
872 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  24.08 
 
 
872 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  24.2 
 
 
874 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  24.07 
 
 
872 aa  89  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.1 
 
 
848 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  24.08 
 
 
872 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.94 
 
 
804 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.1 
 
 
846 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  24.2 
 
 
874 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  24.2 
 
 
874 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  24.08 
 
 
872 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.1 
 
 
848 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  29.1 
 
 
846 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  24.08 
 
 
872 aa  89  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  29.1 
 
 
848 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.1 
 
 
848 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  24.08 
 
 
872 aa  89  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.86 
 
 
730 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
1140 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  24.51 
 
 
734 aa  88.2  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>