29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2369 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2369  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  100 
 
 		 253 aa  510  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  33.47 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  28.75 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  27.94 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  24.55 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  19.81 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  25.11 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  32.49 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  28.29 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  30.08 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  23.16 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  25.21 
 
 		 280 aa  49.3  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  21.89 
 
 		 264 aa  48.5  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  23.9 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  25.1 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  23.14 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  24.27 
 
 		 297 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  23.12 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  22.92 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  27.88 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  21.85 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  22.98 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0340  amidohydrolase 2  25.76 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  27.85 
 
 		 280 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 310 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  26.23 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  22.22 
 
 		 282 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  22.76 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  23.13 
 
 		 255 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>