34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2350 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2350  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  585  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1186  Peptidase M23  64.95 
 
 		 274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1343  peptidase M23B  39.22 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4760  peptidase M23B  40.74 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0227  peptidase M23B  43.75 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0890169  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0199  peptidase M23B  38.34 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  32.8 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  37.89 
 
 		 183 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  31.62 
 
 		 172 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  40.3 
 
 		 174 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  33.67 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  33.33 
 
 		 446 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  37.35 
 
 		 194 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  34.52 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  35.38 
 
 		 199 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  37.93 
 
 		 690 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  28.32 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  29.84 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  37.66 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  32.26 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  29.03 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  37.66 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5572  Peptidase M23  31.79 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  26.73 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  31.63 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  29.03 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  31.63 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2125  peptidase M23B  40 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.883354  normal  0.328475 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  36.21 
 
 		 692 aa  43.1  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  26.21 
 
 		 204 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  34.25 
 
 		 238 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  29.03 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  31.65 
 
 		 448 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.84 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>