75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0864 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  100 
 
 
138 aa  286  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  77.54 
 
 
138 aa  238  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  78.26 
 
 
138 aa  238  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  78.26 
 
 
138 aa  238  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  85.51 
 
 
138 aa  236  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  85.51 
 
 
138 aa  236  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  77.54 
 
 
138 aa  235  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  84.78 
 
 
138 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  84.06 
 
 
138 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  61.03 
 
 
137 aa  183  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  58.09 
 
 
137 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  58.96 
 
 
137 aa  166  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  51.13 
 
 
137 aa  148  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  50.36 
 
 
140 aa  134  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0641  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  45.99 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  36.29 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.79 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  36.79 
 
 
170 aa  77  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  31.93 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.5 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.5 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  29.85 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.35 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  28.03 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.1 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  32.06 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  27.82 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.05 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  23.7 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30 
 
 
267 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  29.77 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  30.91 
 
 
267 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.58 
 
 
273 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  30 
 
 
297 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.78 
 
 
241 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.49 
 
 
325 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.26 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.47 
 
 
524 aa  53.5  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.2 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  25.36 
 
 
154 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.56 
 
 
154 aa  50.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.91 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.36 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  29.25 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.13 
 
 
279 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.43 
 
 
234 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  35.9 
 
 
281 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  29.79 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.94 
 
 
206 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.52 
 
 
335 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4760  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.34 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.78 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  34.85 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.66 
 
 
274 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  24.73 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.66 
 
 
280 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.33 
 
 
397 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3589  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.62 
 
 
287 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.82 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0275  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.34 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.08 
 
 
234 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  29.17 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.17 
 
 
279 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  28.57 
 
 
478 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.57 
 
 
478 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.26 
 
 
221 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  23.53 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.53 
 
 
278 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1980  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.1 
 
 
149 aa  41.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.55 
 
 
284 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0424  hypothetical protein  31.43 
 
 
239 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.36269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2405  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437003  hitchhiker  0.00230018 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  22.76 
 
 
283 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.14 
 
 
263 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0226805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>