84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4209 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4209  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  100 
 
 
86 aa  176  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2012  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  60.98 
 
 
87 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1929  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  60.98 
 
 
87 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1988  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  60.98 
 
 
87 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0290888  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4672  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  59.76 
 
 
87 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3216  CC2985 family addiction module antidote protein  59.76 
 
 
87 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3225  hypothetical protein  56.96 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000332578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2354  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  52.44 
 
 
90 aa  92  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 
82 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1560  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  48.05 
 
 
80 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.72 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.547419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0025  transcriptional regulator  55.56 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1160  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  62.71 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  53.97 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0594  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50.75 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1516  addiction module antidote protein  51.28 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.542717  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1795  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  51.28 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal  0.0311976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0986  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  55.93 
 
 
83 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5139  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  53.33 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.776288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2396  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.22 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3830  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  47.22 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0287  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.53 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4798  transcriptional regulator  43.9 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00706632  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2417  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  54.24 
 
 
82 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2586  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50.85 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0288657  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4231  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  46.75 
 
 
81 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.371092  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5395  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  46.88 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.808179  normal  0.0137087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3156  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.75 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0116  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50.77 
 
 
80 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00623  predicted transcriptional regulator  51.67 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.685731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0124  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50.77 
 
 
80 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6083  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45.45 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0758428  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0160  transcriptional regulator  48.75 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160533  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6482  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  33.33 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.763821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3061  transcription regulator  50.88 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2031  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  43.94 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  43.33 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  43.33 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2830  transcriptional regulator  37.8 
 
 
85 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1707  hypothetical protein  34.12 
 
 
85 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.812427  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2377  transcription regulator  50 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1300  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.42 
 
 
83 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0078  hypothetical protein  44.26 
 
 
80 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1152  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  40 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.622534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2373  CC2985 family addiction module antidote protein  40 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0979  CC2985 family addiction module antidote protein  40 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.819659  normal  0.593839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11988  hypothetical protein  42.86 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3240  transcription regulator  32.89 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0005  CC2985 family addiction module antidote protein  45.45 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1628  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  52.63 
 
 
82 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35476  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2215  transcriptional regulator  38.46 
 
 
86 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6211  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  47.37 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1847  hypothetical protein  39.24 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60040  hypothetical protein  43.86 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786845  hitchhiker  0.00000000572352 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2093  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.18 
 
 
90 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267606  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1359  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  59.38 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4524  addiction module antidote family protein  43.86 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.529015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3537  transcription regulator  45.9 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539095  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2058  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.6 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138913  normal  0.0242142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1315  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.6 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.955845  normal  0.0662167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2828  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.6 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2756  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.6 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3466  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.8 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187433  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3161  putative addiction module antidote protein, family  38.57 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  0.0866726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3114  putative addiction module antidote protein, family  38.57 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00986416  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0572  hypothetical protein  41.18 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0521089  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3609  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  30.12 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5182  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  34.12 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.407541  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3722  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  48.21 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000176838  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4526  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  54.24 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.234903  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4216  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  33.82 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.802046  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3456  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  40.68 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4906  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  45.24 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2643  hypothetical protein  56.67 
 
 
82 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.921856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2505  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  28.92 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2910  transcriptional regulator  46 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.206676  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1025  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  32.53 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0099  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  50 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01564  predicted transcriptional regulators containing the CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain  39.66 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.730888  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3096  putative addiction module antidote protein, family  36 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000273876  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0335  transcription regulator  38.71 
 
 
99 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3027  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  33.33 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  32.76 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0700  transcription regulator  47.73 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>