More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1615 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  85.96 
 
 		 413 aa  732    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  84.53 
 
 		 434 aa  760    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  84.3 
 
 		 434 aa  759    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  82.3 
 
 		 442 aa  722    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  80.5 
 
 		 436 aa  687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  82.91 
 
 		 434 aa  746    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  84.76 
 
 		 434 aa  763    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  84.76 
 
 		 434 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  84.53 
 
 		 434 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  84.06 
 
 		 434 aa  756    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  77.03 
 
 		 443 aa  692    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  84.76 
 
 		 434 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  80.96 
 
 		 436 aa  720    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  84.3 
 
 		 434 aa  759    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  77.03 
 
 		 443 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 435 aa  884    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  77.03 
 
 		 443 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  84.76 
 
 		 434 aa  761    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  82.22 
 
 		 442 aa  715    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  84.06 
 
 		 434 aa  758    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  84.06 
 
 		 434 aa  756    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  84.53 
 
 		 434 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  84.53 
 
 		 434 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  64.35 
 
 		 437 aa  584  1e-166  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  62.97 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  62.5 
 
 		 436 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  62.15 
 
 		 431 aa  546  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  61.97 
 
 		 431 aa  542  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  60.24 
 
 		 435 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  56.84 
 
 		 433 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 		 433 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  57.76 
 
 		 438 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1770  histidinol dehydrogenase  58.63 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.381654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  57.24 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1951  histidinol dehydrogenase  58.39 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0222803  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  58.1 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  57.6 
 
 		 433 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2091  histidinol dehydrogenase  56.67 
 
 		 433 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  57.37 
 
 		 433 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  57.14 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  56.34 
 
 		 442 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  57.37 
 
 		 433 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1585  histidinol dehydrogenase  58.16 
 
 		 428 aa  488  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  56.67 
 
 		 439 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  56.91 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  57.14 
 
 		 443 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  55.5 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  54.78 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  55.24 
 
 		 438 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  53.36 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0098  histidinol dehydrogenase  53.52 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000736266  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  53.43 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  50 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  50.72 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  51.18 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  50 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  52.55 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  50.96 
 
 		 429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  50.48 
 
 		 422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  47.49 
 
 		 867 aa  392  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  49.53 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  51.4 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  51.88 
 
 		 431 aa  388  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 		 431 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  46.39 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  43.79 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  46 
 
 		 852 aa  364  2e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1201  histidinol dehydrogenase  45.03 
 
 		 431 aa  352  8.999999999999999e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1207  histidinol dehydrogenase  44.57 
 
 		 431 aa  348  7e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  43.09 
 
 		 433 aa  345  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89228  Histidine biosynthesis trifunctional protein  44.57 
 
 		 867 aa  344  2e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  40.61 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  44.28 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  42.82 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  41.67 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  45.05 
 
 		 426 aa  319  7e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  42.96 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  43.69 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  40.29 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  42.46 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  41.71 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0753  histidinol dehydrogenase  45.25 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  39.34 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  40.7 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  40.84 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  40.95 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  40.95 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  40.3 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  42.21 
 
 		 416 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  42.59 
 
 		 436 aa  305  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  42.82 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  41.37 
 
 		 416 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  43.17 
 
 		 439 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  42.42 
 
 		 425 aa  302  9e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  41.69 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  38.65 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  42.28 
 
 		 445 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  39.58 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  39.55 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>