More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0999 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0999  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  614  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  64.77 
 
 		 307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4261  LysR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 303 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1127  LysR family transcriptional regulator  64.88 
 
 		 305 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4685  LysR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 301 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2189  transcriptional regulator, LysR family  65.44 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4263  LysR family transcriptional regulator  63.88 
 
 		 305 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2154  LysR family transcriptional regulator  63.55 
 
 		 305 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.224535  normal  0.610808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4759  LysR family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 314 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.983634  normal  0.183649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1029  LysR family transcriptional regulator  65.54 
 
 		 305 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874195  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2889  LysR family transcriptional regulator  64.12 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1151  LysR family transcriptional regulator  64.88 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2357  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  59.4 
 
 		 301 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  0.547268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0672  LysR family transcriptional regulator  64.88 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2104  LysR family transcriptional regulator  59.4 
 
 		 301 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1994  LysR family substrate binding transcriptional regulator  59.4 
 
 		 301 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415294  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1033  LysR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 305 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2451  LysR family transcriptional regulator  64.33 
 
 		 302 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0559  LysR family transcriptional regulator  64.33 
 
 		 302 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2822  LysR family transcriptional regulator  64.33 
 
 		 302 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2878  LysR family transcriptional regulator  64.33 
 
 		 302 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2830  LysR family transcriptional regulator  64.33 
 
 		 302 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2763  LysR family transcriptional regulator  64.33 
 
 		 302 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1774  LysR family transcriptional regulator  64.33 
 
 		 302 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.793189  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1472  LysR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 301 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4320  LysR family transcriptional regulator  60 
 
 		 307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1746  LysR family transcriptional regulator  64.78 
 
 		 303 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3747  LysR, substrate-binding  51.84 
 
 		 301 aa  347  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01787  transcription regulator protein  58.02 
 
 		 297 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.933146 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4053  LysR family transcriptional regulator  57.77 
 
 		 302 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4313  LysR family transcriptional regulator  57.77 
 
 		 302 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3472  LysR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 297 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0615  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 312 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.683803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3985  LysR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 309 aa  335  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0756  LysR family transcriptional regulator  56.4 
 
 		 305 aa  332  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0243  LysR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 302 aa  328  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3986  LysR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 305 aa  325  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2361  LysR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 322 aa  322  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1781  LysR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1052  LysR family transcriptional regulator  56.33 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1067  transcriptional regulator, LysR family  56.33 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0958  transcriptional regulator, LysR family  56.33 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.360669  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1018  LysR family transcriptional regulator  56.33 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0986  LysR family transcriptional regulator  56.33 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5304  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 303 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2842  LysR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 322 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163599  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0225  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5249  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 303 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5159  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 303 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  0.286178 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8248  transcriptional regulator, LysR family  51.19 
 
 		 301 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3137  transcriptional regulator, LysR family  50.84 
 
 		 319 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00811136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33440  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0395632  normal  0.113428 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4092  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.8 
 
 		 315 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3004  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  49.83 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2532  transcriptional regulator, LysR family  46.08 
 
 		 330 aa  262  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2916  LysR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  46.08 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  46.08 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2964  transcriptional regulator, LysR family  46.78 
 
 		 304 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1948  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0632109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2865  LysR family transcriptional regulator  47 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2824  LysR family transcriptional regulator  47 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05302  transcription regulator protein  46.13 
 
 		 329 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2373  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3143  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 336 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937784  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4153  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4265  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.562442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4592  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1405  transcriptional regulator, LysR family  43.64 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  47.6 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1075  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0356329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2226  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 324 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2201  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2542  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  0.053524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2119  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5876  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1541  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 309 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5530  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 324 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2027  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 321 aa  248  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2240  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 325 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 323 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2097  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 323 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 323 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 330 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 330 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2753  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1481  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 301 aa  241  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5499  LysR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2605  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.983354  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2311  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.886713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4416  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2074  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39160  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.255585  normal  0.408672 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5420  transcriptional regulator, LysR family  41.47 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5119  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3335  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1955  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.043876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>