51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3787 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  724    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  67.44 
 
 
346 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  68.01 
 
 
346 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  68.01 
 
 
346 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  68.01 
 
 
346 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  68.38 
 
 
350 aa  494  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  67.24 
 
 
350 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  68.3 
 
 
346 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  68.3 
 
 
346 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  68.01 
 
 
346 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  68.01 
 
 
346 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  67.44 
 
 
346 aa  481  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  65.9 
 
 
349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  63.98 
 
 
346 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  62.29 
 
 
351 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  52.46 
 
 
362 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  49.13 
 
 
358 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  48.56 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  51.6 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  49.85 
 
 
348 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  48.39 
 
 
354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  46.87 
 
 
349 aa  300  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  43.7 
 
 
366 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  40.23 
 
 
347 aa  272  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  40.52 
 
 
347 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  40.52 
 
 
345 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  38.66 
 
 
343 aa  260  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  39.47 
 
 
343 aa  260  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  38.71 
 
 
343 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  39.83 
 
 
343 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  38.78 
 
 
347 aa  250  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  32.04 
 
 
346 aa  156  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  32.12 
 
 
328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  29.38 
 
 
371 aa  96.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  27.3 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  28.09 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  25.55 
 
 
388 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  28.38 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  26.3 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  26.67 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  25.38 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  25.62 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  25.87 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  24.68 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  26.21 
 
 
367 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  26.13 
 
 
367 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  23.58 
 
 
373 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  25.16 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2159  glycosyltransferase family 28 protein  25.69 
 
 
377 aa  53.1  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188732  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2009  glycosyltransferase  22.31 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0518104  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5006  hypothetical protein  24.56 
 
 
363 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>