42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3438 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3438  winged helix family two component response transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3632  response regulator receiver protein  58.66 
 
 		 265 aa  289  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0940  transcriptional regulator-related protein  52.4 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0880  transcriptional regulator, CadC  50 
 
 		 247 aa  242  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102623  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3240  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  51.2 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0783  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  50.8 
 
 		 247 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3343  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  51.6 
 
 		 247 aa  238  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0883  response regulator receiver protein  47.6 
 
 		 244 aa  229  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2749  putative transcriptional regulator, CadC  47.27 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3653  transcriptional regulator, CadC  46.99 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.409424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3459  transcriptional regulator, CadC  46.59 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0833  transcriptional regulator, CadC  46.59 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3534  transcriptional regulator, CadC  46.59 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0760  response regulator receiver protein  45.09 
 
 		 273 aa  208  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0885  transcriptional regulator, CadC  46.83 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0879  hypothetical protein  27.2 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0881  putative transcriptional regulator, CadC  28.12 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0653  hypothetical protein  24.03 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3347  transcriptional regulator  25.3 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.730311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3244  response regulator receiver protein  24.11 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0779  response regulator receiver protein  24.11 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0936  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0793  putative transcriptional regulator, CadC  24.51 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.790637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0757  putative transcriptional regulator, CadC  37.11 
 
 		 151 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.19634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0239  two component transcriptional regulator  37.11 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0357  two component transcriptional regulator  37.11 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0245  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0239  two component transcriptional regulator  37.11 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3781  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0240  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000039366 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0242  two component transcriptional regulator  37.11 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0241  two component transcriptional regulator  36.46 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4487  DNA-binding response regulator  36.46 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4496  two-component response regulator  34.21 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3846  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.225052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0862  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 458 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.657213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  35.44 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3173  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 458 aa  42.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3000  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 458 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000507386  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0836  transcriptional regulator, CadC  33.33 
 
 		 458 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.48 
 
 		 263 aa  42  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>