46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5710 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5710  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  100 
 
 
391 aa  794    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  51.68 
 
 
383 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3119  hypothetical protein  37.37 
 
 
383 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274638  hitchhiker  0.00609959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13270  hypothetical protein  29.7 
 
 
380 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513426  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0403  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  27.9 
 
 
419 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  26.79 
 
 
487 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4611  hypothetical protein  24.73 
 
 
418 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226025  normal  0.0491359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  25.25 
 
 
481 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1454  hypothetical protein  27.27 
 
 
473 aa  73.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3755  hypothetical protein  25.6 
 
 
451 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563494  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3760  hypothetical protein  24.3 
 
 
436 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692051  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  34.57 
 
 
176 aa  59.3  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3936  hypothetical protein  24.66 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  22.91 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  28.73 
 
 
234 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  25.74 
 
 
203 aa  53.1  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  30.97 
 
 
213 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  30.97 
 
 
213 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1450  hypothetical protein  24.72 
 
 
399 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173924  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  28.11 
 
 
219 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  30.08 
 
 
758 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  22.87 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.15 
 
 
196 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  22.13 
 
 
558 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  31.97 
 
 
184 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.34 
 
 
229 aa  47  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  35.23 
 
 
176 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  35.23 
 
 
176 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.5 
 
 
207 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  26.67 
 
 
207 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0427  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 
190 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31941  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  26.67 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  27.5 
 
 
242 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  30 
 
 
183 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  26.67 
 
 
242 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  21.33 
 
 
543 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  28 
 
 
169 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.67 
 
 
207 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  23.19 
 
 
561 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  32.79 
 
 
175 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  32.84 
 
 
230 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1334  glycosyl hydrolase 53 protein  28.25 
 
 
480 aa  43.5  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.22 
 
 
198 aa  43.5  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1565  phospholipase D/transphosphatidylase  28.16 
 
 
191 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  27.27 
 
 
196 aa  43.1  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  28.16 
 
 
191 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>