33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3119 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3119  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  782    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274638  hitchhiker  0.00609959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5710  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.37 
 
 
391 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  35.68 
 
 
383 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0403  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  25.87 
 
 
419 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13270  hypothetical protein  28.22 
 
 
380 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513426  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  21.91 
 
 
487 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  33.33 
 
 
176 aa  53.9  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  31.51 
 
 
758 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4611  hypothetical protein  22.29 
 
 
418 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226025  normal  0.0491359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3755  hypothetical protein  27.35 
 
 
451 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563494  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  23.8 
 
 
481 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3760  hypothetical protein  25.71 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  29.92 
 
 
223 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  28.91 
 
 
207 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  28.91 
 
 
207 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  29.19 
 
 
189 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  28.91 
 
 
207 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  28.91 
 
 
207 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  28.91 
 
 
207 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  28.91 
 
 
207 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  28.91 
 
 
223 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  28.68 
 
 
193 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1450  hypothetical protein  22.97 
 
 
399 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  31.39 
 
 
184 aa  46.6  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  24.31 
 
 
180 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  30.3 
 
 
194 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2751  hypothetical protein  27.78 
 
 
357 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  27.1 
 
 
245 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  30 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.62 
 
 
526 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.36 
 
 
484 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.35 
 
 
207 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  28.35 
 
 
242 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>