29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3959 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  100 
 
 
139 aa  269  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  54.24 
 
 
123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  51.69 
 
 
123 aa  111  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  52.1 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  46.61 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  46.61 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  43.7 
 
 
125 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  50 
 
 
124 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  45.76 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  40.83 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  44.17 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  42.57 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  38.74 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  40.34 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  42.39 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  39.13 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  37.82 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3523  hypothetical protein  39.02 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  35.77 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  41.67 
 
 
191 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  37.6 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  33.04 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4937  hypothetical protein  32.48 
 
 
174 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349534  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0608  DoxX family protein  40 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  38.46 
 
 
126 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  31.62 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  34.4 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  35.59 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4770  DoxX family protein  33.33 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00635642  hitchhiker  0.000154094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>