36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3490 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3490  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 108 aa  216  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.250706 
 
 
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NC_013947  Snas_1476  transcriptional regulator, PadR-like family  53.27 
 
 		 109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_1666  transcriptional regulator, PadR-like family  48.57 
 
 		 109 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.345616 
 
 
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NC_013947  Snas_3569  transcriptional regulator, PadR-like family  44.76 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5040  PadR-like family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194337 
 
 
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NC_013093  Amir_5372  transcriptional regulator, PadR-like family  44.58 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2803  transcriptional regulator, PadR-like family  38.64 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_3190  transcriptional regulator, PadR-like family  44.3 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0392978  normal  0.0453755 
 
 
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NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  43.94 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
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NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  35.58 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
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NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  40.62 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  46.67 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 108 aa  42  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
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NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 114 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_2356  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 118 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_0473  transcriptional regulator PadR-like protein  41.27 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  44.05 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  33.33 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 122 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
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NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3488  transcriptional regulator, PadR family  39.06 
 
 		 109 aa  40  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00705716  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_3469  hypothetical protein  39.06 
 
 		 109 aa  40  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0557218  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  37.33 
 
 		 114 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 108 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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