More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3403 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3403  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  100 
 
 
310 aa  598  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.046263  normal  0.0678818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2310  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  52.23 
 
 
310 aa  258  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6510  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.24 
 
 
309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.267083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8506  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  36.75 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.995989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
307 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3227  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.62 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659744  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.51 
 
 
311 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  36.33 
 
 
323 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
312 aa  132  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.11 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
333 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.24 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5892  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.87 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
333 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.31 
 
 
310 aa  125  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
308 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.14 
 
 
311 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2613  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
316 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0288  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.95 
 
 
313 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.817819  normal  0.0965437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  31.56 
 
 
308 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1067  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.05 
 
 
309 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.72 
 
 
324 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2183  alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4348  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.05 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2447  alcohol dehydrogenase  38.63 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4637  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.71 
 
 
309 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1820  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.1 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746691  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.62 
 
 
317 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.91 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.45 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1183  alcohol dehydrogenase  35.99 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.300688  normal  0.0513369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.42 
 
 
321 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.93 
 
 
336 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  0.659937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  30.57 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.27 
 
 
328 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 
320 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.39 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.73 
 
 
307 aa  115  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.03 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.12 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4019  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.12 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.209092 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1688  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  33.63 
 
 
338 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851726  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.94 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.92 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5331  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5420  alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0066  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
309 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.63 
 
 
331 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.36 
 
 
330 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4293  NADPH:quinone reductase  36.19 
 
 
308 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213277  normal  0.0250565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.43 
 
 
314 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.632176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  33.85 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1716  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
339 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5710  alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  29.5 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.14 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.23 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5695  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.21 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2213  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.71 
 
 
310 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1586  alcohol dehydrogenase  42.23 
 
 
330 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3363  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
333 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  33.43 
 
 
319 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
321 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.05 
 
 
329 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  36.05 
 
 
317 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.68 
 
 
302 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0108316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0165  alcohol dehydrogenase, zinc containing  32.68 
 
 
302 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  31.16 
 
 
358 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0176  alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 
302 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261853  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  30.97 
 
 
339 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 
328 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
339 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.75 
 
 
317 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.02 
 
 
305 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1503  alcohol dehydrogenase  35.21 
 
 
320 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00185871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1494  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  33.33 
 
 
338 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253421  normal  0.032291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
312 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  32.7 
 
 
321 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0168  alcohol dehydrogenase, zinc containing  32.68 
 
 
302 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.662209  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  30.72 
 
 
331 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0162  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
302 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  38.61 
 
 
326 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.55 
 
 
328 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 
339 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  31.42 
 
 
322 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10198  ripening-induced protein-putative Zn-containing oxidoreductase  35.91 
 
 
329 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.622763  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.35 
 
 
307 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  30.92 
 
 
305 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.33 
 
 
331 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  30.42 
 
 
331 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02525  oxidoreductase  33.66 
 
 
307 aa  106  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6116  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.5 
 
 
326 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2209  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.99 
 
 
331 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.29 
 
 
334 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>