30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3035 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3035  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6116  hypothetical protein  27.7 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2839  hypothetical protein  27.61 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.240505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3673  hypothetical protein  30.4 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.141443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2837  hypothetical protein  24.67 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227145  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0411  hypothetical protein  28.85 
 
 		 157 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.445475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2602  hypothetical protein  24.49 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  34.02 
 
 		 1652 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  26.54 
 
 		 656 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.23 
 
 		 667 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 423 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  27.22 
 
 		 1062 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  28.04 
 
 		 423 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  28.04 
 
 		 433 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  26.54 
 
 		 656 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  33.96 
 
 		 435 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 423 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  28.18 
 
 		 1062 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  28 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  27.43 
 
 		 1062 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  28.28 
 
 		 432 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  27.43 
 
 		 1062 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.33 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  23.27 
 
 		 432 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  28.08 
 
 		 1062 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  40 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  25.23 
 
 		 414 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  34.74 
 
 		 1357 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  27.1 
 
 		 433 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  27.1 
 
 		 433 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>